D'après ce que j'ai lu, tu peux très bien utiliser ton pseudonyme, mais sans tiers pour prouver qu'il est rattaché à ta véritable identité, il te sera difficile de prouver la paternité de l'oeuvre. Ce qui, soyons honnête, n'a pas grande importance pour une oeuvre publiée sur Lulu.com ou sur TheBookEdition.com, puisque les ventes dépasseront rarement la centaine d'exemplaires vendus.
Si tu as déposé l'ISBN avec ton pseudonyme, utilises un pseudonyme. Par exemple, pour le recueil de nouvelles JE, nous avons un ISBN attaché au nom "Collectif des Jeunes Écrivains".
Un peu de lecture qui pourrait t'intéresser : Le Droit au Pseudonyme, et Le Pseudonyme (article écrit par la Société des Gens de Lettre, des arnaqueurs, mais qui contient des informations intéressantes).